El rey de Navarra, Juan, heredó la Corona de Aragón de su hermano Alfonso V. Había contraído matrimonio con Blanca de Navarra y, al fallecer ésta, paso a ser rey efectivo (1441) bajo la minoría de su hijo Carlos, príncipe de Viana, pero ya era miembro de la nobleza castellana desde 1412 (duque de Peñafiel) y había ejercido lugartenencias en la Corona de Aragón por decisión de su hermano Alfonso V. El mismo año del fallecimiento del Rey, se dirigió desde Tudela a Zaragoza e hizo la jura en la Iglesia Mayor en manos de Ferrer de Lanuza, Justicia de Aragón, según era costumbre. Tenía el nuevo soberano 61 años, se había casado en 1443 con Juana Enríquez, hija del almirante de Castilla, con la que tuvo a su segundo hijo, Fernando, y poseía bastante experiencia en asuntos de gobierno. Los conflictos con su hijo Carlos, usado como enseña por bandos navarros y catalanes, determinaron serios enfrentamientos para la monarquía en la Península, por lo que debió atender tales asuntos en detrimento de la política mediterránea, que ya no tenía el aliciente del reino de Nápoles, cedido por Alfonso V a su hijo natural Ferrante I. En Cataluña hizo notable alteración la sublevación de los remensas (campesinos adscritos a un dominio señorial; algo parecido a los "vasallos de signo servicio" en Aragón). El conflicto se generalizó, a pesar de los intentos de la corona por resolverlos. y en los años sesenta tuvo como pretendientes al trono a Enrique IV de Castilla, al infante Pedro de Portugal y a Renato de Anjou. En 1469, con el casamiento de su hijo Fernando, ya rey de Sicilia insular (corregnante desde1468) con la heredera de Castilla, Isabel, se iniciaba una etapa de cierta estabilidad, que no llegó hasta la serie de concesiones hechas a la oligarquías de sus territorios, incluido el reino de Aragón, en el que celebró cortes desde 1460, y en las que se precisó la inviolabilidad del territorio aragonés, posibilidad de creación de una fuerza armada aragonesa y soberanía delegada para la Diputación del Reino y el Justicia, además de hacerse preceptiva la nacionalidad aragonesa para ostentar determinados cargos, declarándola para los hijos de los reyes aunque hubieran nacido fuera de Aragón, así como un cierto proteccionismo para la industria y el comercio. Se da como fecha de introducción de la imprenta en Aragón 1475, con la obra Manipulus curatorum de Guido de Monte Rotheri, impresa en Zaragoza por Mateo Flandro. Juan II murió conociendo el fin de su hijo mayor Carlos y el triunfo de su hijo Fernando.